Tā kā tika uzskatīts, ka Plutons arī ir meklētā "planēta X", kas iespaidoja Urāna orbītu, tās fiziskie raksturlielumi pēc aprēķina tika iegūti pārāk lieli. Piemēram, sākumā domāja, ka tā masa un izmēri ir tikpat lieli kā Zemei. taču jau pēc divdesmit gadiem astronomi samazināja tos desmit reizes, bet 1976. gadā - simts reizes, bet 1978. gadā pēc Harona atklāšanas, kas izrādījās pirmais, zināmais Plutona pavadonis, pat piecsimt reizes. Ar tādiem izmēriem Plutons protams nevarēja spēcīgi ietekmēt Urāna orbītu, tāpēc astronomi atsāka "planētas X" meklējumus. Jautājumu slēdza pēc tam, kad "Voyager-2" palidoja garām Urānam un palīdzēja precīzi noteikt šīs planētas masu. Rezultātā zinātnieki konstatēja, ka nekāda papildus iespaida uz tā orbītu nav un vajadzība pēc hipotētiskās "planētas X" atkrita pati no sevis.
Kaut arī pirmā mīkla tika atrisināta, Plutonam izrādījās arī citi pārsteigumi. Harona atklāšana un tā attiecības ar planētu pētījumi parādīja, ka šie abi debess ķermeņi griežas ap kopējo masas centru, tāpēc precīzāk būtu jārunā par dubultplanētu. Taču, kā izrādījās Harons nav vienīgais pavadonis. 2005. gadā atklāja Niktu un Hidru, vēl pēc sešiem gadiem atklāja ceturto pavadoni Cerberu, bet 2012. gadā astronomi paziņoja, ka atklājuši piekto pavadoni, kas vēlāk ieguva vārdu Stiksa. Izskadrot, kāpēc tik mazai planētai ir tik daudz pavadoņu, izrādījās ļoti grūti, tāpēc strīdi par to notiek vēl joprojām.
Ideja par to, ka Plutons ir "aizbēdzis" Neptūna pavadonis, tika ātri atmesta. Tā rašanās sāka noskaidroties tad, kad 1990. gados astronomi sāka atklāt Saules sistēmas tālajās robežās citus objektus, kas pēc lieluma izrādījās līdzīgi. Radās "Koipera joslas" koncepcija, ko tā nosauca par godu holandiešu astronomam Džerardam koiperam. Viņš viens no pirmajiem centās aprakstīt "Aizneptūna" apgabalu kā īpašu telpas apgabalu, kur sakrājušies "celtniecības atkritumi" no tiem laikiem, kad veidojās Saules sistēma. Izrādījās, ka Plutons ir tikai viena no daudzām līdzīgām mazām pasaulēm, kaut arī visdrīzāk pati neparastākā no tām.
Fantasti vienmēr ar lielu interesi skatījās uz Plutonu. Teksti, kas bija veltīti tālajai, dīvainajai pasaulei, parādījās vēl pirms tās atklāšanas. Piemēram, tieši ar Plutonu salīdzina Juggotu - izdomātu planētu no Hovarda Lovkrafta grāmatas. Tieši tur, pēc Lovkrafta, atrodas sena pilsēta, ko kā starpstaciju izmanto baismā citplanētiešu rase Mi-Go, kas spējīga lidot starp zvaigznēm bez kādiem tehniskiem aprīkojumiem. Lavkrafts pareģoja arī Juggota pavadoņu eksistenci. kaut arī apmierinoties tikai ar trīs, ko nosauca par Nitonu, Togu un Toku. Pieminām šo izdomāto planētu var atrast, piemēram, stāstā "Čukstošie tumsā" (1931), ko nesen ekranizēja.
Pirmoreiz ar savu nosaukumu devītā planēta figurē Stentona Koblenca stāstā "Into Plutonian Depths" ("Plutona dzīlēs", 1931). Vēlākie autori vienmēr centās uzsvērt Plutona neparastumu. Stenlija Veinbauma garstāstā "Rudā Peri" (1935) tur atrodas pirātu kosmoosta. Slavenajā Roberta Hainlaina romānā "Skafandrs ir - esmu gatavs ceļot" (1958) Plutons kļūst par citplanētiešu iebrucēju-tārpseju bāzi. Ivana Jefremova utopijā "Andromēdas miglājs" (1957) Plutons pieminēts tikai garāmejot, taču tiek apskatīta interesanta hipotēze, ka tā ir sveša pasaule, ko no vienas kaimiņu planētu sistēmas ir atrāvusi mūsējā, kad divas zvaigznes ir nonākušas tuvāk viena otrai. Jevgeņija Voiskunska un Isaja Lukodjanova romānā "Nelikumīgā planēta" (1980) Zemes cilvēki stājas kontaktos ar seniem radījumiem, kas spējuši pārdzīvot sava spīdekļa bojā eju un Plutona starpzvaigžņu ceļojumu. Dmitrija Jevdokimova garstāstā "Meklējiet mūs kosmosā" (1980) Plutons izrādās Saules sistēmas piektā planēta, ko uz tālajām robežām izmetusi tehnogēna katastrofa, kas gandrīz iznīcinājusi varenu civilizāciju. Interessantas idejas var atrast arī pie mūsdienu fantastiem: piemēram, Kims Robinsons romānā "Icehenge" ("Aishendža", 1985) apraksta milzīgu aizvēsturisku pieminekli, ko atklāj uz Plutona ziemeļpola, bet Gregorijs Benfords romānā "The Sunborn" ("Saules dzemdētie", 2005) rāda saprātīgus plutoniešus, kuri dzīvo pie temperatūras, kas tuva absolūtajai nullei.
Kaut arī astronomi ir tāli no tāda fantāzijas lidojuma, arī viņiem vienmēr gribējās paskatīties uz "nelikumīgo"planētu, tādā veidā aizverot pēdējo, ievērojamo "balto plankumu" nosacītajā Saules sistēmas kartē. 2006. gada 19. janvārī uz Plutonu devās amerikāņu kosmiskais aparāts "Jaunie horizonti" ("New Horizons"). Kamēr aparāts lidoja uz savu mērķi, pats Plutons zaudēja savu Saules sistēmas devītās planētas statusu: tāpēc ka Koipera joslā tika atrasti līdzīgu izmēru debess ķermeņi, un astronomi nolēma pieskaitīt Plutonu jaunām kategorijām "pundurplanētas" un "Transneptūna objekti".
2015. gada 5. maijā aparāts "Jaunie horizonti" pietuvojās Plutonam tik tuvu, ka tā kameras sāka pārraidīt planētas attēlus - daudz smalkākus par tiem, ko bija izdevies iegūt ar teleskopu "Hubble". 14. jūnijā aparāts aizlidoja garām Plutona virsmai apmēram 12 500 km attālumā, savācis ap 50 Gb informācijas par planētu un tā pavadoņiem. dati tiks translēti uz Zemi līdz pat 2017. gada sākumam, taču jau tagad astronomi ir paziņojuši, ka Plutons viņus atkal ir pārsteidzis: senas, sasalušas pasaules vietā viņi ieraudzīja jaunus kalnus un līdzenumus, ko veidojusi nesena tektoniska aktivitāte. Vēl vairāk, uz Plutona ir atklātas zemledus okeāna pazīmes. Planēta turpina apstiprināt savu reputāciju.
Pašreiz notiek Plutona un Harona kartogrāfēšana. Simboliski, ka starp nosaukumiem, ko dos objektiem uz to virsmas, var sastapt arī rakstnieku-fantastu vārdus (Duglass Adamss, Arkādijs Strugackis, Staņislavs Lems), fantastisku radījumu vārdus (Ktulhu, Balrogs un Morgots), fantastisku zvaigžņu kuģu nosaukumus ("Serenity", TARDIS un "Nostromo"), fantastisku filmu un grāmatu personāžu vārdus (Kirks, Spoks, Skaivokers, Lea, Alise un Nemo). Plutona atklāšana debessjumā vēsturiski sakrita ar fantastikas kā iespaidīga literatūras žanra laikmeta sākumu, bet tālās planētas pētījumi paplašinās ne tikai izzinātā robežas, bet arī dos lauku jaunām iztēles spēlēm.